Bioedit是一款支持64位和32位操作系统的分子生物学应用软件,它可以完成核苷酸序列和蛋白质序列设计,提供多个网络程序的分析界面和接口,支持序列对比、序列检索、引物设计、系统发育分析等,软件功能强大,界面精美,上手容易,新手也可以轻松操作。
基本介绍
BioEdit是一个功能齐全的免费分子生物学应用软件,可以完成核苷酸序列和蛋白质序列进行所有常规的分析操作,如:序列比对、序列检索、引物设计、系统发育分析等。与 DNAMAN 相比,其分析内容相对更丰富一些,而且提供了很多网络程序的分析界面和接口
软件功能
1、可以完全核苷酸序列和蛋白质序列进行所有常规的分析操作
2、序列比对、序列检索、引物设计、系统发育分析等
3、与 DNAMAN 相比
4、其分析内容相对更丰富一些
序列对比说明
首先要把所有的序列复制到windows自带的记事本中,全部以fasta格式存到同一个文件中,保存成*.txt,序列内部最好不要有空格或者换行。
序列格式举例如下:
“>序列1
ATCG..........ATCG
>序列2
ATCG..........ATCG
>序列3
ATCG..........ATCG
>序列4
ATCG..........ATCG”
然后用Bioedit打开刚才保存的文件*.txt,点击窗口上方的Accessory application菜单,再点击clustelW multiple alignment,这时候会弹出一个窗口,直接选择Run clustalW,又弹出一个窗口,选择ok,等待结果就行了。
最后的比对结果可以保存成*.fas格式,适用于各种分析。
使用说明
拼接教程:
1、在BioEdit中开启一个序列
2、而后将序列上方的一个菜单:Mode下拉式菜单改为Edit,将光标移动到序列的最末端,从粘贴板上粘贴你要增加的第二个序列就OK了。这样三个序列都前后连接到一起了。
3、这需要一个一个来,十分麻烦。Mega5软件支持将比对后的序列一下子全部放到此外一个比对后的序列后面。因此在序列连接(或拼接)中,用Mega5比BioEdit更好。要注意的是使用Mega5做连接时,要选择Edit/Build alignment,不能是Edit/view选项,不然不能编辑。
文件输出:
点击FileSave As,保存为fasta格式,本例保存为123.fasta,覆盖旧文件。
汉化说明:
1、先行安装原英文版软件,再安装本简体中文包后运行主程序即可。
2、本简体中文语言包是在7.0.1基础上汉化的,同时还可以使用于各个版本的BioEdit。因运用外挂语言包形式,故软件中仍有不少地方显示为英文,不过这不影响使用。
软件评论 您的评论需要经过审核才能显示
网友评论